晚上睡觉感觉肾两侧隐隐的痛，可能为肾脏疾病、腰部疾病，以及皮肤疾病等因素引起。此时建议患者积极到医院就诊，在医生指导下明确具体原因后，给予相应治疗。
一、肾脏疾病：
1、肾结石：主要由于肾脏内盐类物质沉积，可能会形成结石，损伤肾脏黏膜时出现疼痛，晚上睡觉时由于翻身等体位变化，可能感觉肾两侧隐隐的痛。此种情况一般起病急，病症比较重，需要积极给予排石治疗，包括排石颗粒、体外冲击波碎石术等；
2、肾积水：肾积水也会引起晚上睡觉肾两侧隐隐的痛，主要因为肾脏液体排出受阻形成积水，积水使肾体积增大出现胀痛，还会伴随恶心、排尿困难等症状。可使用螺内酯片、呋塞米片等利尿剂治疗；
3、肾囊肿：肾囊肿也会引起晚上睡觉肾两侧隐隐的痛，主要因肾囊肿体积增大、囊内液体增多，进而牵扯肾脏包膜及周围软组织所致，还会伴随高血压的出现。如果肾囊肿比较大，可以进行腹腔镜肾囊肿去顶减压术等治疗；
4、肾炎：肾炎也会引起晚上睡觉肾两侧隐隐的痛，由于炎症牵拉肾脏包膜引起，还会伴随血尿、蛋白尿症状。可以给予厄贝沙坦片、马来酸依那普利片、醋酸泼尼松片等药物治疗。
二、腰部疾病：
1、腰肌劳损：若长期过度劳累，可能会引起腰部肌肉损伤，同时由于肾脏属于腰部，也可以出现晚上睡觉感觉肾两侧隐隐的痛的现象。此时需要保证充分休息，还可以给予腰部热敷等；
2、腰间盘突出症：若患者由于久坐、久站等因素，可能会引起腰部椎间盘部位突出，刺激腰部周围组织，进而出现腰痛症状，但误认为肾痛。晚上睡觉时，可能会刺激腰部突出的椎间盘，也会出现晚上睡觉感觉肾两侧隐隐的痛。此时建议给予牵引处理，避免弯腰等。
三、皮肤疾病：
主要为腰部带状疱疹，由于腰部两侧皮肤受到疱疹病毒感染，可能会刺激腰部两侧皮肤出现疼痛，而误认为肾两侧疼痛，还会伴随皮疹、水痘等症状。此时需要积极给予抗病毒药物治疗，如阿昔洛韦片等，以缓解症状。