一般情况下，如果腹泻是由消化不良导致胰酶缺乏引起的，可以服用。如果腹泻是由病毒、细菌感染等引起且不存在胰酶缺乏的情况，不可以服用。
对于那些由消化不良导致胰酶缺乏引起的腹泻，胰酶肠溶胶囊可以补充胰酶，能够对蛋白质、脂肪、碳水化合物等各类营养物质加速的其分解和消化，使这些食物能够更好地被人体吸收和利用，肠道的消化负担会大大减轻，可以使腹泻的状况得到改善。所以在这种情况下，可以服用胰酶肠溶胶囊。
如果是因为病毒、细菌等病原体感染肠道而引发的腹泻，主要的治疗方向是针对病原体进行抗感染治疗，可以遵医嘱使用阿莫西林胶囊、诺氟沙星胶囊等抗生素或者阿昔洛韦片、利巴韦林片等抗病毒药物进行治疗，在这种情况下不存在胰酶缺乏相关问题，不可以服用胰酶肠溶胶囊。
在日常生活中，要注意饮食卫生，不能食用没有洗干净的蔬菜、水果等，避免饮用生水也是维护饮食卫生的重要方面，生水中可能含有细菌、病毒、寄生虫等致病微生物，直接饮用易导致腹泻、呕吐等消化道疾病。如果在服用胰酶肠溶胶囊或者其他药物过程中出现皮疹、呕吐、腹泻等不适症状，应及时就医。