复方角菜酸酯栓可能会引起腹泻、频繁便意、黏膜受损、过敏反应等副作用，复方角菜酸酯栓由角菜酸酯、二氧化钛、氧化锌等成分制成，可用于痔疮及其他肛门疾患引起的疼痛、瘙痒、肿胀、出血的对症治疗，也可用于缓解肛门局部手术后的不适症状。
1、腹泻：复方角菜酸酯栓进入肛门、直肠后，有润滑肠道的作用，使粪便易于排出，部分比较敏感的人群可能会出现腹泻，表现为大便次数增多等；
2、频繁便意：复方角菜酸酯栓进入肛门、直肠后，属于异物，可能刺激肛周感觉神经，产生频繁便意，但没有大便排出；
3、黏膜受损：在推入复方角菜酸酯栓的过程中，由于紧张、黏膜充血等因素，可能会损伤部分黏膜，甚至会出现点滴状出血；
4、过敏反应：部分人群可能会对复方角菜酸酯栓的药物成分过敏，用药后出现皮疹、瘙痒、荨麻疹、皮肤红肿等症状。
复方角菜酸酯栓有消肿、止痛、止血、止痒功效，角菜酸酯是一种海藻提取物，能够保护直肠、肛门黏膜，有抗炎作用，如果角菜酸酯与粪便混合，可以润滑大便，防止便秘，而氧化锌、二氧化钛有抗炎、止疼功效，能够止痒，同时减轻肛 门、直肠黏膜充血，从而保护黏膜。