葡萄球菌感染后，在形成脓肿前，通常可通过药物治疗缓解症状，可供选择的药物种类较多，建议在医生指导下，根据患者自身的情况，选择适合的药物进行治疗。常用的治疗葡萄球菌感染的药物有β-内酰胺类、喹诺酮类、多肽类、氨基糖苷类等。
1、β-内酰胺类：包括青霉素类药物，如阿莫西林、氨苄西林等，以及头孢菌素类药物，如头孢呋辛、头孢哌酮、头孢克肟等。这类属于广谱抗生素，常作为经验性治疗的用药，可以治疗葡萄球菌的感染；
2、喹诺酮类：属于人工合成抗菌药，抗菌谱也较广，可作为抗葡萄球菌感染用药，如莫西沙星、加替沙星、吉米沙星、左氧氟沙星等；
3、糖肽类：如万古霉素、替考拉宁等，常作为对青霉素过敏者的葡萄球菌感染用药；
4、氨基糖苷类：如庆大霉素、阿米卡星、奈替米星等，对于金黄色葡萄球菌感染较为敏感，而且可作为耐药菌的治疗用药；
5、大环内酯类：临床常用药物有红霉素、阿奇霉素等，可以抗葡萄球菌感染。
此外，其他抗生素如林可霉素、克林霉素以及利奈唑胺等，均可应用于葡萄球菌感染的治疗，必要时还可加用利福平等药物联合治疗。感染葡萄球菌后，应及时完善其他实验室相关检查，在医生的指导下，根据患者的感染部位以及症状，选择合适的药物进行治疗。如果出现化脓的情况，则可能还需要进行手术治疗。