棉签沾酒精掏耳朵，一般不会有危害，但如果使用的是浓度过高的酒精，也就是75%的医用酒精，可能会对皮肤造成一定的刺激，导致皮肤发红、疼痛等表现。
日常在使用高度酒精掏耳朵时，由于酒精对耳道内皮肤的刺激，可能会出现轻微刺痛等不适感。如果耳道还有细小伤口，这时还会感觉到明显疼痛。此外，如果长期用酒精掏耳朵，还可能会因酒精的腐蚀性，导致耳道皮肤出现破损，对健康等不利。日常如果外耳道没有不适的感觉，不建议频繁掏耳朵。因为耳朵的皮肤可以自然产生耵聍，对耳朵皮肤起到保护作用。如果将耵聍掏得太干净，容易产生外耳道炎症。
如果耳道内有炎症的患者，可以遵医嘱选用抗生素滴耳液进行治疗，不建议患者用酒精掏耳朵。此外，在日常生活中，建议健康饮食，避免辛辣刺激性食物，戒烟戒酒。