右侧附件区囊肿有生理性和病理性两种情况，根据囊肿的性质不同，发生的情况也不同。病理性囊肿通常采用定期复查和手术等方法进行治疗。但具体方案应根据囊肿的大小、性质、症状等因素进行相应的治疗。
一、生理性囊肿：
1、囊肿<5cm：生理性囊肿多为卵泡囊肿和黄体囊肿，通常是由于激素水平紊乱后，在卵泡内或黄体腔内形成较多的液体导致，B超检查通常无回声，且直径<5cm，对于这种囊肿无需进行特殊治疗，2-3个月可自行消失。因此建议在2-3个月后复查B超；
2、囊肿＞5cm：若右侧附件区囊肿＞5cm，可以根据患者的情况考虑进行手术，手术方式为腹腔镜手术或开腹手术，将囊肿取出做病理化验，明确囊肿性质。
二、病理性囊肿：
病理性囊肿在进行B超检查时，会发现内部有异常回声，比如高回声、低回声或者有分隔、血流信号等。进行其他检查时，如果发现肿瘤标志物明显升高或者持续存在不消失，则提示恶性囊肿的可能性大。病理性囊肿包括畸胎瘤、浆液性囊肿、黏液性囊肿、巧克力囊肿等，多由卵巢异常病变导致，需要及时进行腹腔镜手术治疗。即体外做数个直径5-10mm的小 切口，通过小切口插入手术器械，完成手术操作。术中根据情况，可能要取组织送冰冻病理检查，判断良恶性。如果是恶性囊肿，会有癌变的可能，建议手术后行放化疗等综合治疗并定期复查，防止癌细胞扩散。如果是良性囊肿，遵医嘱定期复查即可。