酒萸肉和山茱萸由于炮制方法不同，因此功效不完全一样，但两者均具有滋养肝肾、补肾固精气的作用，而经过酒制以后的酒萸肉滋肝补肾作用更强。
山茱萸是使用成熟干燥果实，用小火烘烤或经过沸水煮制以后，去除果核，晾晒至干燥制成，其制作过程不需要进行特殊处理。酒萸肉是选择干净的山萸肉，加入黄酒搅拌均匀，放于密封的容器后，置入加水的锅中，蒸至酒被吸尽，取出晾干制成。
山萸肉与酒萸肉均属于名贵的中药材，两种药物都能起到补肾的作用。山萸肉的功效是补益肝肾、涩精固脱，味酸涩，入肝、肾经，可以补肾固涩。而酒萸肉微温质润，具备温和的性能，且不燥，可使肝肾得到滋补。总而言之，山茱萸的着重点是收敛固涩、止崩、止汗、止尿、固精等，而酒茱萸的性质温润，主要作用是温补肝肾。
如果需要服用山萸肉，患者需要到医院的中医内科就诊，在专业医生进行望、闻、问、切等辨证后选择山萸肉或者酒萸肉使用，切勿自行盲目服用中药材，以免用药不当贻误病情，甚至加重自身症状。