无痛肠镜主要是在静脉麻醉下，经肛门将肠镜循肠腔插入至回盲部，进而观察肠腔是否存在病变，操作主要包括术前准备、进镜、观察、退镜。一般整个过程的时间是指全结肠检查到达回盲瓣之后，加上退镜观察的时间，大约需要15-30分钟，与医生水平、肠道准备情况和肠镜操作内容均有关。如果医生操作熟练、肠道准备良好、无需特殊肠镜操作，一般所需时间较短。
1、术前准备：无痛肠镜检查的前3天，需要进食无渣或少渣的半流质饮食。在检查前6-8小时，还需口服洗肠液，如聚乙二醇电解质溶液，随后进行静脉麻醉；
2、进镜：患者麻醉后处于无感知状态，取左侧卧位、双膝屈曲后，医生操作肠镜从肛门缓慢进入。期间如果肠道结构过于弯曲，或者存在肠粘连，导致肠镜通过困难，可能延长检查时间；
3、观察：主要包括观察直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠以及回盲部，检查是否存在炎症、溃疡或息肉。若存在息肉可以直接切除，随后送检病理检查。另外如果术前肠道准备存在问题，肠腔内有粪水残留，影响术中的观察视野，亦可造成检查时间延长；
4、退镜：医生操作 肠镜沿肠腔退出，待患者意识清醒后即可完成检查。
在结束无痛肠镜检查后，初期需要保持温热的流质或者半流质饮食。如果检查过程中切除息肉，需在术后3天避免冷硬、刺激的食物，同时观察大便颜色，如果出现异常表现，应该及时告知医生。