男人生殖器上长黑点可能是卫生清洁不佳、炎症后反应、受到外界刺激导致的，也有可能是色素痣、龟头炎等疾病因素导致的。如果自身感觉到不适，可能需要到皮肤性病科就诊进行检查，明确原因。
1、卫生清洁不佳：如果男人不注意做好局部卫生清洁工作，会在生殖器部位出现大量黑色污垢，还会伴随轻微瘙痒、异味等症状。此时还应及时使用清水清洗，可以减少污垢。
2、炎症后反应：如果生殖器周围之前存在炎症性疾病，在疾病恢复之后会出现轻微色素沉着的情况，伴随黑色、褐色斑块，一般没有自觉症状，一段时间后即可消退，通常不用进行特殊处理。
3、受到外界刺激：如果自身性生活过于频繁、用力，或者长时间受到内裤摩擦等，也可能会出现色素沉淀。还应适当减少性生活、手淫的次数，或者穿宽松、纯棉的贴身衣物。
4、色素痣：可能和遗传因素、外伤、局部摩擦等原因有关，会在生殖器出现褐色、黑色的斑块，也可能轻微凸出皮肤表面，大多没有不适。对此不用进行特殊处理，减少摩擦，预防癌变即可。
5、龟头炎：主要与细菌、真菌等多种病原体感染有关，患病后会出现局部红肿 、瘙痒、疼痛、异常分泌物，也可能会出现淤血的情况，帮助改善这种情况。对此还应及时在医生的帮助下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物进行抗感染治疗。
此外，这种情况也可能和隐匿性包茎、黑色素瘤等多种原因有关。需要在平时做好保护工作，避免受到外伤，同时减少外界对皮肤黏膜的刺激。