舌头底下的肉疙瘩通常是舌下两侧的颌下腺导管口，属于分泌唾液的正常组织，而舌头底下的肉疙瘩疼可能是颌下腺炎等炎症导致。如果伴随其他不适症状，还考虑可能是比较常见的舌下腺囊肿，也有可能是不太常见的腺样囊性癌。
1、颌下腺炎：如果颌下腺导管口出现疼痛，多是由于导管阻塞导致，即颌下腺炎，患者可表现为颌下腺红肿，疼痛，伴有脓性分泌物。此类患者可以在医生指导下口服抗炎药物和清热消肿药物，比如头孢类抗生素等，平时应尽量清淡饮食，还应多喝水、多吃富含维生素的食物等；
2、舌下腺囊肿：如果舌头底下长了个肉疙瘩，出现明显疼痛，黏膜呈紫蓝色，触摸时质地柔软且有波动感，比正常组织体积大，则考虑可能是舌下腺囊肿。该病较为常见，主要是由于舌黏膜下的小黏液腺导管堵塞，分泌的唾液潴留所引起。一部分患者会出现疼痛感觉，但症状不明显，囊液流出后囊肿会变小，而囊液逐渐出现、累积后则会缓慢变大。正常情况下需要考虑进行舌下腺囊肿根治术，即通过手术切除舌下腺，预后通常比较好；
3、腺样囊性癌：舌头底下长了个肉疙瘩疼，还应考虑是腺样囊性癌导致，虽然属于舌下腺好发肿 瘤，但从整体而言，并不是十分常见。肿瘤早期表现为无痛性肿块，一般不大，后期可以出现间断性或持续性疼痛，目前主要治疗手段是手术切除，术后配合化疗药物预防转移。