系统性硬化症一般不能治好，但在积极配合医生的治疗下，可以控制及改善病情。每个患者的病情不同，严重程度也不一样，不能完全确定患者具体能活几年，通常5年存活率为58%-100%。此外，系统性硬化症的预后取决于内脏血管损伤的范围及程度。多数研究指出，如肾脏受损，继而累及心脏、肺的患者，通常存活率明显降低，存活时间相对减少。肾受损是弥漫型系统性硬化症常见的死亡原因之一，即使较轻度的肾脏受损，也可使预期寿命缩短。
系统性硬化症会导致患者出现皮肤萎缩、脱发、红斑、关节疼痛等症状，需要及时至风湿免疫科就医，采取合适的应对措施，避免延误最佳治疗时间。如果疾病不及时治疗，会影响患者的正常生活，早发现、早治疗可以避免较多风险。系统性硬化症的患者一般可以通过药物治疗的方式改善病情，可以在医生指导下，使用甲氨蝶呤片、他克莫司软膏等药物。如果患者出现手指溃疡、严重坏死，可能需要截肢手术。部分病情严重的患者还需要进行自体造血干细胞移植、间充质干细胞治疗等治疗。