那屈肝素钙和依诺肝素钠，都是在临床上比较常见的低分子量肝素制剂。常用于深部静脉血栓及肺血栓，有利于预防及治疗栓塞性疾病，其作用基本一致，但还存在一定的差别，主要体现在分子结构、作用疗效方面。
1、分子结构：两者主要区别是钠盐和钙盐的不同，那屈肝素钙结合二价的钙离子，而依诺肝素钠是结合一价的钠离子；
2、作用疗效：对依诺肝素钠而言，钙离子是凝血因子中的Ⅳ因子，现有的体外研究已经证实了高浓度肝素会对钙离子产生螯合效应，这就容易造成依诺肝素钠注射部位的皮下局部组织中钙离子浓度降低，从而增加局部出血的风险。而那屈肝素钙在钠盐转变为钙盐的过程中，已经预先结合了钙离子不再螯合皮下组织中的钙离子，从而减轻了皮下出血的风险。所以相比较来说，那屈肝素钙既可以抗凝血、消血栓，性质又比依诺肝素钠更稳定、安全，局部出现血肿的概率更低，副作用也要更少。
两种药物都可以用于抗凝治疗，效果也类似。如果对于其中一种药物有过敏反应，可以在医生的指导下选择另一种药物进行治疗。