并不是所有的急性胃肠炎都需要使用抗生素治疗，只有明确为细菌感染引起的急性胃肠炎才可以使用抗生素，此时首选喹诺酮类药物，但也受人群限制，包括一般人群、特殊人群等，因此建议积极就医，遵医嘱选择用药，以免自行用药不当引发不良反应。
1、一般人群：细菌感染引起的急性胃肠炎首选抗生素为喹诺酮类，如左氧氟沙星、诺氟沙星、洛美沙星等。喹诺酮类抗生素主要对引发急性胃肠炎的革兰阴性杆菌如大肠埃希菌、副溶血性弧菌等有良好的抗菌效果，能够彻底消灭病原菌，口服吸收效果较好；
2、特殊人群：喹诺酮类药物用药有人群限制，如18岁以下的未成年人和孕妇不能服用，因可能会导致未成人软骨发育不良和导致胎儿畸形。未成年人出现细菌感染导致的急性胃肠炎，可以选用三代头孢类抗生素如头孢克肟、头孢他美酯和头孢地尼等，主要对革兰阴性菌有良好抗菌作用。而孕妇则应住院治疗，在医生的指导下合理选用对胎儿没有影响或者影响较小的头孢类抗生素，如头孢氨苄、头孢拉定等。
临床导致急性胃肠炎的原因较多，如暴饮暴食和病毒感染等，此类因素引起的急性胃肠炎则不需要使用抗生素。如 果滥用，不仅不会起到治疗作用，还可能会因为不合理使用抗生素引起肠道菌群失调，进而加重疾病。