吃头孢有可能会引起便秘，但并不是头孢的直接作用所引起，而是因为头孢可杀灭肠道内的有益菌，导致肠道菌群失调而引起，若便秘不严重，一般停药后会所有减轻。
因为头孢抗菌谱较广，在用头孢治疗病原菌感染时，在杀灭病原菌的同时，会把肠道内很多有益菌也杀灭，所以会导致肠道内有益菌数量减少。而肠道内很多有益菌可帮助肠道分解、消化食物，如果肠道内有益菌数量减少，有可能导致消化功能减退，引起胃肠蠕动减慢，而导致便秘。
此时可遵医嘱使用益生菌调理肠道功能，帮助消化，如乳酸菌素片。但需注意在使用有益菌治疗时要和头孢分开服用，防止头孢对有益菌产生杀灭作用，可以先服用头孢，等头孢在肠道内完全吸收后，再服用有益菌调理肠道，以达到满意效果。
另外，吃头孢后引起便秘，还要多注意饮食方面的调理，要注意多喝水，多吃富含粗纤维的食物，防止便秘发生，饭后也可适当运动，以促进胃肠蠕动。