脖子甲状腺位置隐隐作痛可能与甲状腺相关炎症、甲状腺恶性肿瘤等原因有关，患者应积极就医完善相关检查后，针对不同病因进行治疗。
1、甲状腺相关炎症：如桥本甲状腺炎，属于自身免疫性甲状腺炎症，可出现甲状腺肿大、疼痛的症状，建议完善甲状腺血清学检查及甲状腺功能相关抗体检查，排除是否有甲状腺感染性病变，患者可遵医嘱应用地塞米松等激素类药物治疗，肿大明显时可进行手术治疗，术后定期随访甲状腺功能，评估是否需要补充左甲状腺素钠片等药物；
2、甲状腺恶性肿瘤：其病因尚不确定，可能与遗传因素、电离辐射、碘摄入异常等因素有关。多数患者在疾病早期不会出现明显的不适症状，随疾病发展，癌细胞发生局部淋巴结转移或者局部肿瘤浸润周围肌肉及神经等，可出现疼痛症状。患者应积极配合医生进行手术治疗，或者进行化疗、放疗、靶向治疗等综合治疗。
除上述因素外，部分患者出现甲状腺结节或甲状腺囊性改变时，内部出现出血情况，可能导致局部组织血肿或水肿，肿胀组织压迫神经也可出现疼痛症状。此时应进行彩超检查明确诊断，必要时需穿刺抽液或者进行手术切除治疗。