两个月的宝宝哭的时候咳嗽，可能与空气刺激等生理性原因有关，也可能与呼吸道感染、胃食管反流等病理性原因有关，需具体情况具体分析。
一、生理性原因：
两个月的宝宝在剧烈哭闹时呼吸程度较深，导致大量冷空气进入口腔刺激咽后壁和气管，导致咽后壁和气管痉挛，从而引起咳嗽症状。
二、病理性原因：
1、呼吸道感染：如果两个月的宝宝本身伴有呼吸道感染，哭时可以导致鼻腔内出现较多鼻涕，鼻涕倒流至咽后壁，可以刺激咽后壁造成咳嗽；
2、胃食管反流：两个月的宝宝的胃部相对水平，容易发生胃食管反流，哭闹时腹压增高可以加重胃食管反流，胃内容物刺激咽喉而造成咳嗽；
3、哮喘：如果两个月的宝宝存在哮喘，本身呼吸道黏膜便存在高敏反应，在哭闹时气流刺激呼吸道，造成呼吸道平滑肌痉挛而引起咳嗽。
如果两个月宝宝哭时咳嗽，随着哭闹程度减轻，咳嗽的程度也可以逐渐减弱。如果两个月的宝宝哭闹特别严重，甚至频繁咳嗽，造成呕吐，家长可以将两个月的宝宝抱起，用温柔的话语安抚，可以在一定程度上减弱宝宝哭闹的程度，使咳嗽 逐渐减轻。