金匮肾气丸和知柏地黄丸的区别主要在于药物成分、作用、治疗疾病以及禁忌等方面，因此，患者在服用这两种药物时，需遵循专业医生的指导，切勿盲目使用。
1、药物成分：金匮肾气丸主要是由牡丹皮、泽泻、桂枝、附子、牛膝、车前子、地黄、山药、山茱萸以及茯苓等药物组成，而知柏地黄丸主要是由熟地黄、知母、黄柏、山茱萸、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻等中药材组成；
2、作用：金匮肾气丸可起到化气行水、温阳补肾的作用，而知柏地黄丸可起到滋阴降火的作用；
3、治疗疾病：金匮肾气丸主要用于治疗肾虚水肿、小便不利、畏寒肢冷以及腰膝酸软等病症，而知柏地黄丸通常用于治疗阴虚火旺证，常见症状有虚烦盗汗、咽部疼痛、耳鸣、遗精、小便短赤等；
4、禁忌：孕妇一般不可以服用金匮肾气丸，且在服用金匮肾气丸期间应避免同房，还需避免摄入生冷的食物，如冰镇饮料、冰淇淋等，以免影响药效。通常情况下，脾虚湿盛、大便溏泄或实证的人群忌服知柏地黄丸，且孕妇以及儿童需要在医生的指导下用药。