内镜色素检查一般是指色素内镜检查，属于消化道内镜检查中的一种，是针对细微的消化道黏膜病变而进行检测的一种手法，患者可在清醒或全身麻醉条件下进行。
色素内镜检查是将色素溶液在胃镜检查时喷洒在消化道黏膜表面，观察黏膜的细微凹凸及颜色改变，进一步明确病变的性质、大小或范围，提高病理活检的阳性率。常用的检查方法有对比法、染色法及反应法。对比法是指利用喷洒在消化道黏膜表面的色素可沉积在黏膜凹陷处的特点，增强胃黏膜的立体性，观察黏膜有无隆起或凹陷，辨别良恶性病变，这种方法常用的染色剂有靛胭脂、煌蓝、伊文思蓝等。
染色法是喷洒色素后，观察活体组织对于染色剂的吸收程度，一般情况下正常黏膜不被染色，而肠上皮化生、异型增生及癌变的黏膜因具有吸收功能而被深染，常用的是美蓝。反应法是指利用染色剂与黏膜组织发生特异性反应而呈不同颜色的特点，观察病变性质及范围，多应用于早期食管癌的诊断，常用的染色剂为碘溶液。
需要进行色素内镜检查的患者可以先前往医院消化内科就诊，患者在进行色素内镜检查前需要注意禁食，检查前进食食物对检查不利，可能会影响检查结果。