真菌是具有真细胞核，可以产生孢子且不含叶绿素的一群细胞生物，其广泛存在在自然界当中，总数可达10万余种，包括霉菌、酵母菌、曲霉菌、表皮癣菌以及菌菇类，其中对人类有致病性的真菌约有300多种。除新型隐球菌和蕈外，医学上有意义的致病性真菌几乎都是霉菌，如青霉属、曲霉属以及着色霉属等，另外念球菌属、小孢子菌属等也具有致病性。根据真菌侵犯人体部位的不同，临床上可通过真菌寄生部位导致的疾病将真菌分为三类，包括浅部真菌、皮下组织真菌、深部真菌。
1、浅部真菌：常见致病真菌包括黄癣菌、大小孢子菌、毛癣菌、噬动物真菌、红色毛癣菌、白色念珠菌等，通常侵犯人体的皮肤、指甲以及毛发，常由于直接接触感染所致。浅部真菌所导致的疾病通常简称为癣，可分为头癣、手癣、足癣、股癣、甲癣以及体癣；
2、皮下组织真菌：常见致病菌包括孢子丝菌、着色芽生菌、暗色丝孢霉菌、曲霉菌等，常形成肉芽肿和化脓性损害，临床表现为疣状或菜花状增生，间有化脓性病变。少数表现为窦道和管，侵犯骨、肌肉等较深组织，破坏性大；
3、深部真菌：主要包括组织胞浆菌、球孢子菌、芽生菌、类球孢子菌、隐球菌、孢子丝菌、念珠菌、曲菌菌、毛霉菌等，此类真菌侵犯皮下组织、黏膜和内脏，会引起感染性疾病，包括局限性的单一器官感染和2个或2个以上器官侵犯的系统性真菌感染，所致的危害性大，死亡率高。