一觉醒来一只眼睛肿了还疼，可能是生理性因素和病理性因素所引起。建议症状持续不缓解或出现其他不适时，需及时就医、明确病因，并在医生的指导下进行对症治疗。
一、生理性因素：
如果在睡前饮用大量的水，或用眼过度，导致身体的水分在眼部积聚，出现眼部浮肿的现象，就可能会造成一觉醒来一只眼睛肿了还疼的情况。通常不需要特殊治疗，可用冰块对眼部进行冷敷，且日常生活中，养成良好的生活习惯即可。
二、病理性因素：
1、麦粒肿：如果患者不注重眼部卫生，经常用手揉眼睛，容易致使细菌侵入眼部，眼睑受到细菌感染，出现炎症，导致一觉醒来一只眼睛肿了还疼的现象，通常还伴有异物感、发红、疼痛等症状。可以通过热敷、按摩等物理治疗缓解症状，还可在医生的指导下使用左氧氟沙星滴眼液、红霉素眼膏等药物治疗；
2、过敏：如果患者床上有容易导致过敏的物质，如花粉、粉尘、螨虫等，再加上睡觉姿势不当，致使一侧眼部接触到过敏原，刺激眼睛产生过敏反应，就会出现一觉醒来一只眼睛肿了还疼的现象，并伴有眼部发红、发痒、心悸、呼吸困难、皮肤红疹等症状，可以通过氯雷他定片、妥布霉素地塞米松滴眼液等药物进行缓解。
建议患者在用药期间，谨遵医嘱用药，不可盲目用药，以免病情加重。此外，还需注意眼部卫生，不要长时间使用电脑、手机等，以免眼睛疲劳。饮食上需营养均衡，多吃水果蔬菜，少吃辛辣、刺激性食物。