微小乳头状癌是恶性。因为癌本身的定义就是来源于上皮组织的恶性肿瘤，所以只要有癌的字眼，大多数都可以理解为是恶性的疾病。
微小乳头状癌来源于甲状腺组织，是由于甲状腺细胞发生突变，转化成恶性的肿瘤细胞。微小乳头状癌的癌变范围的径线不超过10mm，没有发生区域淋巴结转移，也没有发生远处器官的转移，同时癌细胞也没有侵犯到甲状腺以外的正常组织。
微小乳头状癌在早期时，癌细胞很小的时候，是一种隐匿状态，甚至在进行影像学检查时都无法发现。但微小乳头状癌一旦生长超过2mm，就会有新生的血管，这种血管为肿瘤组织提供血液供应，这个时候微小乳头状癌就具有了生长增殖的能力，不过大部分的微小乳头状癌就停留在这个阶段，不会进一步发展而危害身体。只有少部分微小乳头状癌会进一步发展，从而发生淋巴结转移，甚至发生远处器官的转移。
虽然微小乳头状癌是恶性疾病，但相对来说它是一个危害较小的疾病，微小乳头状癌生长缓慢，治疗方法也很简单，如果是早期发现，通过手术切除就可以使绝大部分病人得到治愈。因此，一旦发现微小乳头状癌，建议尽早治疗。