胎儿室间隔缺损的自愈率，需要根据缺损的部位判断，如果是膜周部、肌部的室间隔缺损，自愈率在20%-50%，如果是肌部流出道型室间隔缺损，通常没有自愈几率，此类室间隔缺损需要及时采取治疗措施。
胎儿室间隔缺损是由于在胚胎发育过程当中，心室间隔发育不完全而引起，是指心脏右心室和左心室之间的室间隔出现一块缺损，属于先天性心脏病中比较常见的类型，根据缺损的位置分为膜周型、肌部型等。胎儿室间隔缺损存在自愈几率，但根据其类型不同，自愈几率也会存在一定差距，如果是膜周部和肌部室间隔缺损，通常有自愈可能，自愈率可以达到20%-50%，一般在5-6岁以前会逐渐自愈。但如果是肌部流出道型室间隔缺损，通常不会自愈，主要是因为该类型室间隔缺损容易发生主动脉瓣脱垂，危险性较高，应及时采取相应治疗措施，以免出现不良后果。
通常可以采取手术治疗的方式治疗胎儿室间隔缺损，如肺动脉环缩术、室间隔缺损修补术、食管超声引导下小切口室间隔缺损封堵术等，通过手术能达到较好的治愈目的。