蒲公英根的副作用主要包括腹部不适、脾胃受损，而蒲公英根的禁忌分为人群禁忌和药物禁忌，脾胃虚寒的患者禁服，同时禁忌与忍冬、麻黄、桂枝等药物同时配伍。
一、副作用：
蒲公英根是菊科植物蒲公英的干燥根茎，功效与蒲公英一样，有清热解毒、消肿散结、利尿通淋的功效。由于蒲公英根味苦、性寒，所以如果大量服用，可能会导致患者出现腹胀、腹痛、腹泻等腹部不适，而长期过量服用，还容易导致患者的脾胃受损，使脾胃的运化功能减弱。所以建议患者经专业中医师辨证论治后，在其推荐下应用蒲公英根，避免自行盲目用药后，对身体造成上述伤害。
二、禁忌：
1、人群禁忌：因为蒲公英根性寒，脾胃虚寒的人群要禁忌服用蒲公英根，否则容易出现腹泻、腹痛、畏寒、神疲乏力等症状，导致病情加重。另外，对蒲公英过敏，以及先天体质虚弱、久病的人群，也不能够喝蒲公英根；
2、药物禁忌：由于蒲公英根性质偏凉，不建议与辛热药物同服，如麻黄、桂枝、防风、细辛、生姜等，可能会影响蒲公英根药物寒性特征，导致其无法发挥清热解毒的功效。