舌侧矫正与其他的牙齿矫正方式在操作上，以及技术上都有较大的区别，很少人选择舌侧矫正有多种原因，主要有影响发音、技术要求高、不易清洁、费用较高等。
1、影响发音：舌侧矫正将矫治器安装在牙齿舌面上，舌侧矫正后，患者需要花时间去适应矫治器在舌侧的情况。舌头是很敏感的发音器官，触及矫治器时，在一定程度上会影响舌头的灵活性，从而影响发音；
2、技术要求高：舌侧矫正通过将矫治器全部安装在牙齿的舌侧面，从而进行正畸治疗，不易进行观察和操作，对医生的技术要求较高，且其为新兴技术，目前国内该项技术还未像唇侧矫正一样普及和成熟；
3、不易清洁：托槽矫治器安装在舌侧，矫治器之间的空隙较小，食物残渣不易清理，而矫正是一个长时间的过程，一般要治疗2-3年。若在这个过程中未做好清洁，容易导致龋病等病变且病变发生在舌侧，和唇侧矫正相比不易早期发现；
4、费用较高：牙齿舌侧形态变异比牙齿唇侧大，相对于隐形矫正、正常的唇侧矫正，舌侧矫正的矫治器精密度要求更高，费用相对较高，且舌侧矫正技术要求高，诊疗费用也会相对较高。