人体不可以自己产生益生菌，益生菌通常是指肠道的有益菌，最初由分娩时母亲的阴道、空气中的细菌以及食物中获得，人体无法自己产生益生菌或其他细菌。
当人体缺乏益生菌时，可能出现便秘、腹泻等胃肠道疾病。益生菌进入人体后可以选择性地定植到人体肠道黏膜表面，抑制有害菌群的生长，可使肠道菌群保持平衡，对肠道功能具有保护和改善作用，因此常用于治疗便秘、腹泻。
日常生活中，可以通过进食一些食物来增加肠道益生菌的数量，比如酸奶、泡菜、各种发酵豆制品等由发酵所得的食物。必要时也可以在医师指导下服用益生菌制剂来补充肠道益生菌，例如双歧杆菌乳杆菌三联活菌片、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等。尽管肠道益生菌可以通过食物及益生菌制剂进行补充，但需要注意益生菌制剂不可随意自行服用，需在专业医师的指导下用药。