宝宝睡着后老是摇晃脑袋，可能是由于生理性因素和病理性因素导致，比如缺乏维生素D和钙、湿疹等。如果已经影响到宝宝的睡眠，白天出现嗜睡、没精神等情况，建议家长及时带宝宝到医院就诊，进行针对性处理。
一、生理性因素：
如果宝宝睡觉时环境不佳，如枕头过硬、过于吵闹、衣服不舒服等，都可能使宝宝出现睡着后摇晃脑袋的情况。同时由于宝宝本身新陈代谢较快，如果天气较热、宝宝被子太厚，导致宝宝头部出汗，宝宝感觉到头部不适，就会通过摇晃头部来缓解症状，家长应及时根据情况进行调整，宝宝的不适症状会逐渐消失。
二、病理性因素：
1、缺乏维生素D和钙：如果宝宝体内缺乏维生素D和钙，尤其是在缺钙质的情况下，容易导致宝宝神经肌肉兴奋性增强，使宝宝出现多汗、烦躁不安、夜惊等症状，表现为宝宝睡着后老是摇晃脑袋。家长可以遵医嘱适当给宝宝服用维生素AD滴剂、葡萄糖酸钙锌口服溶液等药物治疗；
2、湿疹：受环境湿度、温度刺激或受过敏原刺激等，可能导致宝宝头部出现湿疹，会伴有严重皮肤瘙痒的症状，宝宝出现不适感会通过摩擦皮肤缓解，表现为宝宝睡着后老是摇晃脑袋。可遵医嘱使用炉甘石洗剂、丁酸氢化可的松乳膏等药物局部涂抹，缓解症状；
3、其他原因：如消化不良、癫痫、中耳炎、过敏等，均可能导致宝宝睡着后老是摇晃脑袋，需明确病因进行治疗。如由于宝宝的胃肠道系统没有发育成熟，可能会因为喂养不当、腹部受凉等原因使宝宝出现消化不良的情况，如腹胀、腹泻、腹痛等，进而表现为宝宝睡着后老是摇晃脑袋，可以在医生的指导下给宝宝服用枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。