小孩病毒感染肚子疼可能是消化不良、急性胃肠炎、胃肠型感冒、肠系膜淋巴结炎等因素导致，建议在医生指导下针对性治疗。
1、消化不良：如果小孩近期进食较多，或进食不易消化的食物，且此时小孩受病毒感染，机体免疫力较弱，影响胃肠功能，致使进食的食物滞留在胃肠内，与胃肠道内的菌群发生反应时会出现疼痛的症状，可使用枯草杆菌二联活菌颗粒、多潘立酮混悬液等药物治疗。
2、急性胃肠炎：当小孩受到病毒感染后，病毒在机体内大量增殖并释放毒素，刺激胃肠黏膜，导致黏膜出现黏膜充血、水肿、分泌物增加，致炎症渗出，从而会出现肚子疼的现象，可使用硫糖铝混悬凝胶、肠炎宁颗粒等药物治疗。
3、胃肠型感冒：通常是病毒感染导致胃肠功能紊乱，当病毒累及到胃肠道时，会导致胃肠黏膜出现炎症，致使胃肠道蠕动增快、胃肠道痉挛等，出现肚子疼的情况，可使用对乙酰氨基酚颗粒、布洛芬干混悬剂等药物治疗。
4、肠系膜淋巴结炎：当小孩受到病毒感染后，病毒进入体内，会随着血液循环，当病毒达到肠部，引起肠道出现炎症反应，且回肠远端肠系膜淋巴引流丰富，升结肠 区域淋巴结较多，当肠道黏膜受到炎症因子的刺激，致使出现肚子疼、表浅淋巴结肿大等不适症状，可使用阿莫西林颗粒、盐酸伐昔洛韦颗粒等药物治疗。
除了以上原因外，食物中毒、生冷刺激也会导致小孩肚子疼，建议家长陪同前往医院小儿消化内科就诊，通过视诊、磁共振、血常规等相关检查，明确病情，积极配合医生治疗。