自热火锅有一定的致癌风险，偶尔或少量食用自热火锅，对身体的危害相对较少，不用过于担心。但长期大量食用自热火锅，则存在致癌的可能，因此，不建议长期大量食用自热火锅。
自热火锅的外包装一般是塑料，部分非正规的产品在高温状态下，可能会释放出具有致癌作用的有害成分，如果长时间食用，可能会出现口腔、食管或者胃肠道癌症。另外，食用自热火锅时温度通常较高，高温食物进入口腔、胃肠道后，会对黏膜造成刺激和损伤，从而出现溃疡。如果长期得不到有效治疗和恢复，则有癌变的可能。为了延长自热火锅中食材的保质期，制作过程中会添加防腐剂、食品添加剂，长时间食用后，也有一定的致癌风险。
自热火锅主要通过焦炭粉、生石灰、活性炭等物质与水发生化学反应，从而产生加热的热量。在食用自热火锅时，如果加热包出现损坏，则不能继续食用，否则石灰融入食材中，进食后可能会导致消化道灼伤。此外，操作时还需注意安全，以免造成皮肤烫伤等情况。