药物的肝肠循环对机体影响，主要是延长药物半衰期和作用维持时间，不同的药物经肝肠循环可造成的影响不同，但常对肝脏、消化道造成影响较大。
药物的肝肠循环是指药物经肝脏转化，代谢物经胆汁排入肠腔，其中一部分被小肠重吸收后，又由门静脉回流入肝，然后再经胆汁排入肠腔的一种循环形式。药物的肝肠循环可减少药物的排泄，使其排泄时间减慢，药物半衰期和作用维持时间延长，一般有利于药物发挥作用。
药物经过肠肝循环，血药浓度和半衰期都可能延长，如果不按照医嘱用药，自行增加药物用量，可能会导致血药浓度过高，超过药物警戒线，产生一定的毒副作用。
因此在临床用药时，需要医师控制好药量，而患者在使用药物时，应严格遵医嘱用药，以免对机体产生不良影响。