酵母菌有细胞结构，酵母菌具有典型的真核细胞结构，具有细胞壁、细胞膜、细胞核、细胞质、液泡、线粒体等，部分还具有微体。其还含有蛋白质、维生素B等营养物质，具有抗氧化、保护消化系统、促进人体新陈代谢的作用。虽然酵母菌对人体的益处较多，但不宜过量摄入，食用酵母菌时，应咨询专业医生，注意摄入量。
市面上常见的酵母菌多为干酵母，其中含有一定量的硒、铬等矿物质，其具有一定的抗氧化作用，可以保护人体肝脏，提高肝脏的解毒功能。此外，酵母菌可作为发酵剂、添加剂和调味剂，能够帮助消化胃肠道内的内容物，减少胃肠道的负担，保护人类的消化系统，当患有消化系统疾病时，可以遵医嘱适量食用酵母菌，改善消化系统疾病造成的腹胀、腹痛等不适症状。同时，酵母菌中含有维生素B，适量食用可以营养神经，改善睡眠质量，并且酵母菌中还含有大量的葡萄糖，能为人体提供能量，促进人体新陈代谢。
但是，酵母菌含有的嘌呤量较高，所以对痛风患者而言，不宜食用含有酵母菌的食物，否则易导致嘌呤堆积，形成尿酸，从而引发痛风。