肺肉芽肿性结节通常是一种良性病变，可由多种因素引起，一般分为感染性因素和非感染性因素两大类。临床上需要专业医生结合患者具体情况，以及相关检查来明确病因。
一、感染性因素：
一般是病原体侵入肺部后发生炎性反应，诱导吞噬细胞在感染部位聚集，吞噬侵入身体的病原体，最后形成肺肉芽肿性结节。常见可诱发肺肉芽肿性结节的病原体有细菌、真菌、结核分枝杆菌、寄生虫、梅毒螺旋体等，其中以结核分枝杆菌引起的肺结核最为常见。作为感染性肺肉芽肿性结节，不同病原体引起的肉芽肿病变，存在一定差异。
二、非感染性因素：
1、异物：一般是由于小颗粒异物经呼吸或手术进入肺部，同样诱导巨噬细胞聚集，并逐渐吞噬异物，从而在局部形成肺肉芽肿性结节；
2、结节病：这种肺肉芽肿性结节主要由上皮细胞、多核巨细胞和淋巴细胞构成。属于非坏死性上皮样的肉芽肿，而且病变一般没有发生干酪样坏死；
3、全身系统疾病：如坏死性血管炎，以及部分恶性肿瘤等，也会引起肺肉芽肿性结节。肺嗜酸性肉芽肿性多血管炎，也会在肺内形成肉 芽肿性结节，主要以嗜酸粒细胞浸润为主。
此外，药物反应、免疫系统功能性紊乱，也可能在肺部发生肉芽肿病变，形成肺肉芽肿性结节。不同病因导致的肺肉芽肿性结节，病理组成也不相同，临床上可以根据肉芽肿的特点，来分辨导致肺肉芽肿性结节的病因。