咽口水上腭靠后疼，在排除外伤的情况下，可能是出现了上呼吸道感染，如鼻炎、咽炎、扁桃体炎等，也可能是溃疡所致。如果自身无法明确为何种原因，建议积极就诊于呼吸内科等相关科室，以查明原因，采取相应处理。
1、上呼吸道感染：常为病毒感染所致，少数为细菌感染，可导致上呼吸道，包括鼻腔、咽喉、扁桃体出现急性炎症，鼻咽、扁桃体黏膜便会出现水肿、红肿、疼痛，吞咽口水或食物时就会出现上颚靠后部位疼痛的感觉，有时可见肿大的扁桃体。治疗上可遵医嘱用银黄含化片、蒲地蓝消炎口服液等缓解疼痛症状；如果还伴有发热症状，可应用退热药物如布洛芬、对乙酰氨基酚治疗；如果存在病毒感染，可遵医嘱服用抗病毒药物，如更昔洛韦、阿昔洛韦等；如果存在细菌感染，还可对致病菌进行药敏试验，以便选用高敏感抗生素，常见抗生素包括头孢克肟、阿莫西林等。饮食以流食为主，多吃一些新鲜蔬菜、水果，多喝水，饭后及时漱口，保持口腔卫生；
2、溃疡：咽口水上颚靠后疼可能是出现了溃疡，溃疡面红肿或呈黄白色，吞口水或进食也会疼痛。溃疡的治疗主要是全身可应用口炎清颗粒，局部可用开喉剑喷雾 剂、西瓜霜，以及糖皮质激素类溃疡贴等，促进局部黏膜愈合，一般10-14天即可痊愈，平时应该注意口腔卫生，多喝水。