阴超的探头需要消毒，阴超的探头有固定的消毒时间。在给患者做阴超检查时，会用柔软的布擦拭阴超的探头，如果患者有皮肤破损等情况，则会对阴超的探头进行严格消毒。
临床上进行阴超检查时，医生会将阴超的探头套上探头套，在进行检查时会做到一人一换，同时操作者也会戴无菌手套，不会直接接触患者的阴道黏膜，可有效防止疾病传染。如果患者存在皮肤破损，或存在传染病，在给患者做完阴超检查后，医生会对阴超的探头进行深度消毒，需使用酒精擦拭阴超的探头，起到消毒作用。医院通常会有规定的消毒时间，采用消毒凝胶或专用酒精对阴超的探头消毒，患者可放心做阴超检查，并不会造成交叉感染。
患者在做完阴超检查后，应适当进行休息，不要过度劳累，以免影响身体的恢复。还需要注意的是，在进行阴超检查后的当晚，如果需要同房，在同房前应清洗外阴，以免导致感染。