肠道清洁欠佳，大多会影响肠镜结果。因为肠道清洁欠佳，通常说明肠道内存有大量粪便，覆盖在肠黏膜表面，不利于观察黏膜状态，会影响检查者对病变的判断。且残留的粪便还可能会附着在镜头位置，影响视野。
肠镜检查前，建议患者充分清洁肠道，可以遵医嘱服用复方聚乙二醇电解质散、乳果糖口服液等药物清洁肠道。同时可配合应用盐酸达克罗宁、二甲硅油散等消泡剂辅助改善肠道黏膜状态，使内镜下观察效果达到较佳状态，还可以通过清洁灌肠的方法，促进肠道排空，预防肠镜结果受影响。
另外，肠镜检查前，还需要注意评估心肺情况，需要完善心脏超声、心电图、胸片或者胸部CT、肺功能等检查。在身体情况及病情允许情况下，建议停用阿司匹林肠溶片、华法林钠片等具有抗血小板聚集、抗凝成分的药物，防止增加内镜下活检过程中出血的风险。