女性月经期间、排卵期间都可能出现早上起来小腹疼的症状，此时无需特殊处理，属于正常的生理现象。排除上述因素后，消化系统炎症、生殖系统炎症、生殖系统囊肿、消化系统肿瘤，以及生殖系统肿瘤这几类疾病也会导致上述症状，需要及时明确病因，采取相应的治疗措施。
1、消化系统炎症：如果女性前一天进食刺激性较强，或者不卫生的食物，在夜晚经过胃肠道的消化吸收后，可能会导致消化系统炎症，引起女性腹痛，同时还可能会伴有腹泻等症状。另外其他炎性疾病，比如阑尾炎、结核性肠炎等，也会引起女性腹痛；
2、生殖系统炎症：如子宫炎、盆腔炎、输卵管炎等，在炎症因子的刺激下，可能会导致女性出现相应不适症状，同时还可能会伴有分泌物异常、外阴瘙痒等症状；
3、生殖系统囊肿：常见的生殖系统囊肿病变为卵巢囊肿，一旦囊肿发生扭转，则可引发女性小腹部疼痛，这种疼痛较严重，而且不可自行缓解，需要就医处理；
4、消化系统肿瘤：有可能是由于肠道肿瘤等因素所致，多由病灶压迫了局部发血管、神经或产生了梗阻引起，此类女性早期可以有大便性状、习惯、颜色等方面的改 变；
5、生殖系统肿瘤：多数为子宫肌瘤类疾病引起，也有可能得卵巢癌等疾病，女性可以出现月经异常表现，通常需要做B超、宫腔镜等妇科检查明确。
除上述常见情况外，如果小腹部患有皮肤肿瘤，女性也可能会出现上述症状，此时通常还伴有局部肿胀。