耳朵里面流水还臭臭的需要确定感染类型，才能选择所用药物。出现上述症状常见于细菌感染、真菌感染等，可以使用滴耳液、口服药物、静脉用药治疗。
1、细菌感染：由于肺炎链球菌、嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌等细菌感染，导致耳朵里面流水还臭臭的情况，表现为稀薄脓液，或者黄色、白色脓液。建议选用抗生素滴耳液进行滴耳，比如氯霉素滴耳液、氧氟沙星滴耳液等，必要时，可联合青霉素V钾片、去痛片、布洛芬缓释胶囊等药物缓解疼痛；
2、真菌感染：由于耳朵的外耳道处于狭长、深在的状态，这种环境下容易引起真菌生长，也会表现出耳朵里面流水还臭臭的情况，可能会看到耳道深部有白毛一样的新生物，需要进行检测并使用抗真菌药物，常用如克霉唑乳膏、克霉唑溶液、硼酸洗液等，还可以使用诺氟沙星葡萄糖注射液、注射用头孢唑林钠、地塞米松磷酸钠注射液等药物治疗。
由于耳朵有一定的自净作用，因此平时生活中不建议自行掏耳。如果使用不干净的棉签、掏耳勺去挖耳，可能会再次诱发耳朵里面流水还臭臭的情况。