肺移植后5年存活率低，常见原因有移植术后感染风险大、移植术后排斥反应重、患者自身状态差等。虽然肺移植后5年存活率并不理想，但是随着医学技术的进步，有望得到改善。
1、感染风险大：肺移植术后患者需要使用免疫排斥药物抑制免疫功能，免疫能力下降后较容易继发感染，导致肺功能衰竭。尤其是移植单侧肺脏，另外一侧肺脏轻度感染可能继续加重，甚至导致严重的败血症。因此，患者的五年存活率会比较低；
2、排斥反应重：肺移植手术后其排斥反应相对较重，在急性期就可能导致病人死亡，如急性排斥反应引起肺功能衰竭。即使在慢性排斥反应阶段，也容易造成肺功能障碍，使肺组织发生坏死，最终导致患者5年存活率低的情况；
3、患者自身状态差：如果患者在进行肺移植前自身状态较差，如存在心力衰竭、肝功能衰竭等，即使采用了肺移植，术后短期内能挽救病人的生命。但患者多器官功能也会逐渐衰竭，因此，生存时间也较难超过5年。