用美沙拉嗪栓感觉肛门不舒服可能是生理性原因，也可能是药物不良反应，若是出现刺痛、烧灼等药物不良反应，需要停止用药调整治疗方案，防止病情加重。
1、生理性原因：美沙拉嗪栓主要用于治疗克罗恩病和溃疡性结肠炎，能直接作用于肠道黏膜炎症处，可以起到消炎镇痛的作用，由于是在直肠用药，因此塞入肛门时会使肛门部位受到刺激，比如可能会使局部出现坠胀感和肛门不舒服的感觉，不适程度主要和患者自身敏感度有关。随着药性吸收，症状会消失，不需要特殊治疗；
2、药物不良反应：美沙拉嗪栓用药后若患者对药物成分过敏，可能会出现药物不良反应，如可能会出现肛门部位刺痛、烧灼等症状，可伴有头晕、口干、腹泻、恶心、呕吐、便秘等其他症状，出现后需要停止用药，可及时就医更换药物治疗相关疾病。
需要注意，患者在药物治疗期间应避免食用辛辣刺激性的食物，建议以清淡、软烂、富有营养的饮食为主，多吃富含维生素的食物，进餐时要细嚼慢咽。