培菲康通常指双歧杆菌三联活菌制剂，妈咪爱是指枯草杆菌二联活菌颗粒，两者区别在于药物成分不同、药物机制不同、适应证不同。
1、药物成分不同：双歧杆菌三联活菌制剂是由长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌活菌制成。枯草杆菌二联活菌颗粒是由活菌冻干粉、屎肠球菌、枯草杆菌、维生素C、维生素B1、维生素B2、维生素B6、维生素B12、烟酰胺、乳酸钙、乳酸钙制成。
2、药物机制不同：双歧杆菌三联活菌制剂是直接补充正常生理性细菌，调节肠道菌群，抑制肠道中对人体具有潜在危害的菌类甚至病原菌，起到治疗疾病的效果。而枯草杆菌二联活菌颗粒是通过枯草芽孢杆菌和屎肠球菌，调节人体肠道环境，促进肠道正常菌群的生长繁殖，抑制肠道致病菌的生长，从而有效地保护肠道，且其中含有婴幼儿生长发育必需的维生素以及微量元素，有助于婴幼儿的生长发育。
3、适应证不同：双歧杆菌三联活菌制剂多用于治疗肠道菌群失调引起的腹泻和腹胀，以及轻中度急性腹泻及慢性腹泻。枯草杆菌二联活菌颗粒主要用于治疗消化不良、食欲不振、营养不良，以及肠道菌群紊乱引起的腹泻、便秘、腹胀、肠道内异常发酵、 肠炎，使用抗生素引起的肠黏膜损伤等病症。
如果需要使用以上两种药物，建议家长陪同前往医院小儿消化科就诊，通过血常规、血生化、便常规等相关检查，明确病情，积极配合医生治疗。