长效干扰素治疗小三阳的成功率，是指通过长效干扰素治疗乙肝表面抗原转阴的比例，由于停药时间不同，治疗小三阳成功率也有所差异。根据慢性乙型肝炎防治指南(2019年版)中的临床研究统计数据，乙肝小三阳患者治疗48周、停药24周后，乙肝病毒表面抗原的阴转率仅有3%，停药3年后乙肝表面抗原的阴转率为8.7%，停药5年后乙肝表面抗原的阴转率为12%，表明干扰素停药后还会有一定的持续性作用。
如果患者患有小三阳，需要应用长效干扰素进行治疗，需要在专业医生指导下进行用药，不可擅自更改药量，以免引发机体不适。此外由于长效干扰素存在一定的副作用，如淋巴肿大、血小板减少、记忆力障碍等，如果患者出现此种症状，需要咨询医生看是否需要更换药物。
与此同时除了应用干扰素治疗小三阳外，患者还可应用核苷类抗病毒药物治疗，如恩替卡韦片、替比夫定片等。此外，如果患者病情严重，已经到肝硬化失代偿阶段，可考虑进行肝移植手术。