从生物遗传的角度来讲，近亲生的孩子不正常是由于基因相似，存在隐性致病基因可能大，因此，近亲生的孩子不正常概率较一般非近亲生子女异常的概率大，更容易患有多种遗传疾病，也更加可能造成不良妊娠结果，但近亲生子也不一定会不正常。
由于夫妻双方为近亲，遗传基因相似度高，如果双方皆携带某些疾病的隐性基因，此时父母可能表现正常，但二者的遗传病隐性基因可能会同时遗传给后代，造成其子女为双隐性基因，从而导致子女患遗传病。因此，近亲生育的子女患有遗传病的几率较非近亲的夫妻更高。
此外，即使没有同时获得两个隐性基因，该夫妻生育出来的孩子携带隐性基因概率也会增加，增加后代的遗传风险，为个人和家庭带来严重的负担。因此，为了避免不必要的生育风险，我国法律禁止近亲结婚生子。