正常情况下，正确使用牙线棒一般不会造成危害，对牙齿清洁有一定的好处。只有在错误使用牙线棒或使用牙线棒过于暴力时，可能产生危害，导致牙龈出血、感染等情况发生。
1、牙龈出血：使用牙线棒用力过度或使用不正确时，可损伤牙龈，引起牙龈出血，对牙龈不利。需注意使用牙线棒清洁过程中，避免过度用力；
2、局部感染：常见牙线棒通常为一次性用品，使用过后牙线棒上可携带细菌，如反复使用牙线棒，可使细菌侵入口腔，对口腔卫生造成影响，也可引起口腔疾病。
正确使用牙线棒对清除牙缝里的菌斑有一定的好处，正确使用方法为左右移动牙线棒，将牙线缓慢滑进牙缝并紧贴牙齿邻面一侧，自龈沟最深处轻轻上下拉动，清洁该牙齿邻面，然后将牙线紧贴另一边牙齿邻面重复上述步骤进行清洁，直至清洁所有牙齿邻面为止。