小孩两个眼睛不对称，可能是生理原因所致，也可能是上睑下垂、先天性青光眼、泪囊炎、其他原因等病理原因导致，家长需及时带小孩到医院眼科就诊，完善视诊、眼底裂隙灯等检查，以明确具体原因。
一、生理原因：
一般情况下，由于小孩的眼部肌肉发育不完善，或者眼睛一个是单眼皮，另一个是双眼皮，看起来左右眼睛会一大一小，导致小孩两个眼睛不对称，一般不需要特殊处理。
二、病理原因：
1、上睑下垂：可能是遗传因素引起，也可能是眼部外伤导致上睑下垂，使小孩出现视物模糊、斜视、重症肌无力等症状，上睑下垂还可能会造成眼睛部分被遮住，从而出现小孩两个眼睛不对称的症状，可在医生指导下采用额肌悬吊手术治疗；
2、先天性青光眼：是指胎儿在发育过程中，眼睛发育异常引起，可能会导致小孩出现眼睛畏光、眼睑痉挛、弱视、斜视等表现，还可能会导致病变一侧眼球增大，出现小孩两个眼睛不对称的症状，可在医生指导下采用房角切开术治疗；
3、泪囊炎：是眼科常见病，好发于春秋季节，主要是细菌感染导致泪囊堵塞引起，异物刺激、下鼻甲肥大、萎缩性鼻炎等因素也会导致泪囊炎，炎症刺激导致小孩出现眼睑肿胀、泪囊皮肤糜烂等症状，因为眼睑肿胀，可能会出现小孩两个眼睛不对称的情况，可在医生指导下采用内囊摘除手术治疗；
4、其他原因：如先天性睑裂狭小综合征、斜视、虹膜异染色质等，均会因上睑下垂、眼位偏斜等原因导致小孩两个眼睛不对称，需要针对病因进行治疗，以斜视为例，因为眼位偏斜而出现两眼不对称的表现，如内斜视、外斜视等，小孩还可出现畏光、视力下降等不适症状，可通过配镜的方法进行矫正。
小孩两个眼睛不对称时，应积极遵医嘱进行治疗，同时要注意眼部卫生，不要用不洁的手揉搓眼睛，避免吃辣椒、大蒜等刺激性食物，以免加重感染，影响病情恢复。