相对于一次扫描一个部位，一次扫描多个部位的CT辐射剂量要大一些，但通常情况下，即便是进行全身CT检查所产生的辐射，也不至于导致人体出现严重的疾病。
通常一次胸部CT检查，被检者所受的辐射剂量大约为七毫希弗，腹部、盆腔普通CT检查的辐射剂量约十毫希弗，颅脑CT检查的辐射剂量约为二毫希弗，腹部、盆腔增强CT的辐射剂量大约是二十毫希弗，颅脑CT增强检查四毫希弗。如果是进行多个部位检查，则辐射剂量就会叠加，比如进行颅脑和胸部的普通CT检查，则辐射剂量大约是九毫希弗。
大剂量的辐射对人体的血液系统、生殖系统、循环系统、免疫系统可能会造成影响，会使血液中白细胞下降，可能会出现乏力、头痛、失眠等不适症状。还有可能会影响男女双方卵子和精子的质量，可能会影响胚胎发育，出现流产等。此外，由于甲状腺部位对X射线比较敏感，长期接受大剂量辐射可能会增加患甲状腺癌的风险，需引起重视。
检查时尽量避免接触辐射源，比如在进行检查前用铅衣遮盖住未被检查的部位，在检查结束后需要多喝水，也可以适当喝些浓茶、可乐等促进排泄，同时需多锻炼身体，有利于增强机体修复辐射 损伤的能力。