一般情况下，在吃药期间，不建议喝黑咖啡。除黑咖啡之外，吃药期间也不建议食用浓茶、白酒、火锅等刺激性食物，以免降低药效，影响药物的治疗效果，从而加重病情，不利于疾病的治疗。
虽然药物和黑咖啡的成分并不一定存在相互作用，但是药物具有一定的刺激性，而黑咖啡的味道也较为苦涩，同时也具有一定的刺激性。因此如果在服用药物过后喝黑咖啡，使胃肠道黏膜持续受到刺激，则可能损伤胃肠道黏膜，容易影响药物成分的吸收和利用，影响药物疗效。因此，为了使病情尽快恢复，通常建议待身体完全恢复之后，再喝黑咖啡。
黑咖啡中通常含有较为丰富的营养物质，黑咖啡中含有水分、脂肪、蛋白质、糖类、纤维素，以及钙、磷、铁、钠、维生素B2、烟酸、咖啡因、单宁等物质。如果适当喝黑咖啡，有助于机体补充上述营养物质。但是黑咖啡中含有大量的咖啡因，可以促进神经兴奋，在睡觉之前，尽量避免喝黑咖啡，以免造成入睡困难或者影响睡眠质量。在日常生活中，通常建议在日间适当饮用黑咖啡，可以提神醒脑。