胃镜病理报告是指做胃镜时切取的病理组织的检查报告，胃镜报告一般是指胃镜检查报告。胃镜病理报告与胃镜报告的区别主要表现在检查方法、报告内容、报告准确性三个方面。
1、检查方法：胃镜主要是通过纤维镜由口腔进入食管、胃、十二指肠后，通过镜头转动，能够较直观地观察胃肠道黏膜的变化以及占位性病变，同时可以进行镜下治疗，如切除病变组织、套扎止血等。胃镜病理检查则是通过胃镜检查钳取或切除病变组织，经过切片、固定染色等方式处理后在显微镜下观察细胞、分子等改变；
2、报告内容：胃镜检查得到的结果较宏观，报告时偏重于形态学的描述，如镜下胃黏膜改变、息肉、肿瘤等等，提出的治疗意见有限；而胃镜病理检查包括细胞学、病理诊断、免疫组化病理诊断、基因检测等，可以确诊病变的良恶性质，并且可以通过免疫组化基因检测等，选择敏感的化疗方案及生物细胞制剂，以及指导手术切除范围；
3、报告准确性：胃镜报告主要针对病变表面的改变，对内部病变观察有限，胃镜病理报告是针对细胞、分子在镜下的观察，相比之下胃镜病理报告更加准确；如果二者报告出现 误差，应以病理报告结果为准，以便采取最佳治疗方案。