两周岁宝宝阴茎只有一厘米，如果是14天大，一般属于正常现象，无需特殊处理。如果是宝宝两周岁，可能为正常现象，也可能是隐匿性阴茎或小阴茎，建议及时带宝宝到医院的小儿泌尿外科就医，在医生指导下判断及处理。
1、正常现象：如果两周岁宝宝阴茎只有一厘米，但无其他表现，如包茎、排尿不畅等，可能是宝宝发育前的正常现象，一般到宝宝青春期的时候阴茎发育速度才较快，因此无需担心；
2、隐匿性阴茎：主要因为宝宝先天阴茎脚不固定，或者因为肥胖因素，使整个阴茎体埋藏于耻骨联合下方。可表现为包皮外板短，包皮口呈现鸟嘴样异常，包皮与阴囊融合，但是阴茎体发育良好，勃起状态能够伸长。一般可在3-5岁是进行隐匿性阴茎手术；
3、小阴茎：小阴茎是因为雄激素受体不敏感，或者其他因素造成的雄激素释放减少，以及5α还原酶缺乏原因，导致阴茎体缺乏雄激素的刺激，造成海绵体不发育或者发育不良，使得阴茎长度低于同龄宝宝阴茎尺寸的两个标准差。小阴茎本身不是手术治疗的指证，一般推荐全面检查宝宝的染色体、基因外显子、性激素6项、双氢睾酮水平以及雄激素激发试验等，对小阴茎的病因进 行针对性的诊断。治疗时可以遵医嘱使用双氢睾酮凝胶外用刺激阴茎海绵体生长，或者选择HCG刺激治疗。