甘蔗汁过夜了是否有毒不能一概而论，需具体情况具体分析。
如果甘蔗汁在低温的环境中存放，如在冷藏的环境中或者在冬季的环境中存放，因为天气比较寒冷，并不适合细菌或者霉菌繁殖。而且在存放甘蔗汁期间做了严格的密封处理，通常情况下并不会出现细菌或者霉菌污染，也不会生成有毒物质。以上情况下，喝了过夜的甘蔗汁后可以正常吸收其中的营养物质，不会对身体造成伤害。
但如果是在夏季炎热的环境中存放甘蔗汁，或者没有在冰箱中密封保存。由于天气比较炎热，细菌和霉菌的活跃度比较高，甘蔗汁容易出现细菌或者霉菌污染，产生毒素，导致甘蔗汁变质，进入体内后可能会出现中毒反应，也会引起胃肠道炎症。通常情况下，此类甘蔗汁需要避免喝。
需要注意甘蔗汁属于一种含糖分偏高的食物，如果本身存在糖尿病或者高血糖的人群，需要减少喝或者避免喝甘蔗汁。此类人群过量喝了甘蔗汁以后，可能会引起血糖的控制难度增加，加重糖尿病的病情，身体肥胖的人群也需要控制摄入量，以免导致肥胖。