自闭症的治疗一般并无明确的最佳年龄，通常考虑自闭症治疗的年龄越早越好，并且建议不要超过6岁。自闭症的治疗主要是通过干预训练，较大限度地促进患儿各方面能力发展，使患儿能够适应社会，以改善患儿的生活质量。
一般情况下，2-6岁是自闭症患儿康复训练的关键期，因此建议在患儿早期明确诊断后即可开始积极的治疗，在患儿过了6岁后再进行训练，治疗效果会相对降低。通常自闭症患儿的干预训练包括应用行为分析法、图片交换沟通系统和地板时光疗法等。应用行为分析是运用行为治疗的原理和方法，对自闭症患儿进行早期强化干预的一种方法。图片交换沟通系统适用于没有语言发育，或者是不能用语言交流的学龄前患儿，利用代偿非语言交流的方式来传递信息，对于患儿有强烈激励作用，容易被接受。地板时光疗法是针对患儿社会交往缺陷，根据患儿能力水平，给患儿建立互动，创立亲密关系，鼓励患儿表达情绪感受和想法，建立患儿的逻辑性思维。
此外，其他治疗包括物理治疗和药物治疗，如经颅磁刺激、音乐治疗，以及使用利培酮、阿立哌唑等药物治疗，具体应在医生的指导下选择合适的方式及早开始治疗。