通常情况下，甲状腺手术时患者可以穿内裤。因为甲状腺手术部位在颈部，距离会阴比较远，一般不会污染到手术部位。需要进行腹部手术，大腿、会阴等部位手术的患者，不需要穿内裤，以防污染手术区域。
但是如果医生不让甲状腺患者穿内裤进手术室，可能是存在一些情况。例如经医生评估部分患者的手术时间比较长，需要在术前留置尿管，所以不能穿内裤。或者是担心手术难度比较大，术中可能会出现大出血、粘连严重等问题，手术时间难以估计，需要在术中留置尿管，一样不能穿内裤。
所以大部分情况下，甲状腺手术患者都可以穿内裤。如果医生嘱咐不可以穿内裤，也不要害羞，应该保持积极的心态配合医生。同时也无需过于担心隐私的问题，在甲状腺手术时会在患者私密部位覆盖一些无菌的中单或者大单，保护患者隐私。